Shaak túlélte a Geonosisi arénában a vérengzést és egy új Klónhadosztályt vezetett a Szeperatista erők ellen. Harcolt az Első Kamino-i csatában, hogy megvédje a klónserdülőket. Ti tábornok végig elsőként harcolt a csatában és számtalan kaminoi életét megmentette.
Egy jedi különítmény elindult a bolygóra megsemmisíteni az ott lévő droidhaderőt és a droidgyárat. Őket támogatta egy teljes klónhadosztály. Ahogy az Acclamator hajók kiléptek a hiperűrből jópárat lelőtt a Szeperatista tűz. Miután a megmaradt egységgel landoltak, gyorsan körülvette a droidhadsereg és teljesen elpustította a Köztársasági Erőket.
A 6 megmaradt jedi felé közeledő droidhadsereg hirtelen megállt. Grievous állította meg őket, hogy ő maga tiporja sárba a lázongó jediket. A harc elején még a jedik voltak a kezdeményezők, de a csata közben a Tábornok 3 jedit legyőzött, így már csak Aayla Secura, Ki-Adi-Mundi és Shaak Ti maradt. Egy óvatlan pillanatban Grievous kiütötte Aaylát és Mundit. A kiváló jedimester próbállta felvenni a harcot a kiborggal, de nem sok esélye volt ellene. A harc végén Ki-Adi-Mundi megmentette az életét, még az előtt, hogy a klónhadosztály megérkezett volna. A klónok érkezését 3 jedi élte meg, de csak Mundi tábornok ment el a saját lábán. A két hölgyjedi súlyos sérüléseket szenvedtek, de gyorsan felépültek.
A támadást ő vezette és segített kiszabadítani Shogar Tokot.A küldetés kényszerítette arra, hogy szembenézzen egykori tanítványának, Fe Sunnak a gyilkosával, Lyshaaval. A harc végén Shaak Ti legyőzte ellenségét és kimentette a jedi fogjot. A küldetés után őt jelölték ki Palpatine egyik személyi testőrévé. Később több sikeres és sikertelen csatában is részt vett, de legtöbbször sikeresen tért vissza a Jedi Tanácsba.
Dagu-i csata
Kilenc hónappal a háború kitörése után Shaak Ti-t és klónegységét elfogták és bebörtönözték Dooku legveszedelmesebb tanítványa, Artel Darc vezetésével.De Darc túl naív volt, nem tartott a mester erejétől és igen szabad "pórázon" fogta.Ezt drágán megfizette, mert egy alkalommal a hölgyjedi kiszabadult és párbajozni kezdett vele.Shaak Ti legyőzte a sötét jedit és a Köztársaság is megnyerte a csatát.Palpatine egy medált adott neki ajándékba dicséretül.
Bebörtönzés a Metalornon
Shaak Ti-t újra bebörtönözték körültekintetlensége miatt, de most Watt Tambor nagyon vigyázott, hogy ki ne szabaduljon a jedi: Unlearn City legjobban őrzött börtönének a mélyébe zárta. Nemsokkal utána Organa szenátor kívánt tárgyalni a békéről és ellátogatott a Metalornra. Tambor megmutatta neki Unlearn City érdekesebb helyeit. Organa viszont érdeklődött a börtönök iránt, persze már tudott róla, hogy egy jedi van a cellák mögött. A szenátornak sikerült ellopnia a mester fénykardját és sikeresen le is jutattatta Shaak-nak. Miután befejezték a látogatást, Shaak kiszabadította magát és a lelepleződés után a szenátor és a jedimester sietve távoznak a bolygóról a Tantive IV-en. Shaak igéretet tesz Bail-nek, hogy ha bármikor segítségre szorul segít neki ha tud. A politikus persze még nem tudja, hogy nemsokára szüksége is lesz erre az ígéretre.
Coruscant-i csata(Klón Háborúk)
Shaak egy magnadroid ellen
A háború vége felé a jedi egyre több információt kapott meg a második sith-ről,Darth Sidiousról.Kinyomozták, hogy hol lehet és Winduval, Roron Corobbal és Foul Moudamával illetve igen edzett klónokkal elindultak a sith feltételezett odujába.Még mielőtt odaértek volna óriási droidhadsereg támadta meg a Coruscant-ot és vissza kellett fordulniuk megvédeni a kancellárt.A csata alatt rengeteg magandroiddal megharcolt, sikeresen, pedig ezeket Grievous képezte ki direkt a jedik ellen.Ennek ellenére későn ért a kancellár irodájába, de nagy árat fizetve megmentették őt és elindultak Palpatine föld alatti bunkerébe.Az út során Shaak Ti hátra maradt és szembeszállt sok magandroiddal , illetve Grievoussal.Egy idő után a droidok abbahagyták a támadást, ekkor Ti mester rájött, hogy Grievous már a bunkerben van.Mikor odaért már csak a testőrök és a jedik holttesteit találta.
Nagy Jedi tisztogatás (66-os parancs)
Miután Anakin megjött a hírrel, hogy Palpatine a sith nagyúr Shaak Ti-re bízták a feladatot, hogy megvédje a Templomot, míg Windu,Kit Fisto,Saesee Tiin és Agen Kolar mester elmennek feltartóztatni a Sith Lordot. Percekkel a parancs életbelépése előtt Ti mester találkozott Anakinnal aki épp Windunak indult segíteni. Shaak Ti megpróbálta visszatartani az ifjú jedit, de ő arra hivatkozva, hogy ő a Kiválasztott elindult.
Shaak Ti ott volt a Templom elesésekor. Tudva, hogy nem lehet ellenfele Darth Vadernek és az 501-es Légiónak, elhagyta a Coruscantot és a Feluciara ment, ahol Jedi társait Aayla Securat és Bariss Offeet már megölték. Kicsivel később találkozott a Jedi Maris Brooddal, aki bosszút esküdött Vader ellen. Shaak Ti felajánlotta neki, hogy rejtőzzenek el a Felucian, ahol ő felkészítheti Marist, hogy végezzen Vaderrel és annak titkos tanítványával. Ám a tanívány, Galen Marek Vader utasítására a bolygóra ment és végül megtalálta Shaak Ti mestert. Ádáz harc bontakozott ki köztük. Shaak Ti meglátta Marek-ben a jót, és azt mondta neki, hogy lehetne sokkal jobb, de csak a jó oldalon. Hogy bizonyítsa ezt, Shaak Ti beleugrott egy óriás sharlacc-ba, és itt lelte halálát.. Marek megpróbálta megmenteni őt, de sikertelenül. Ezzel bizonyította, hogy ő már igazi jedivé vált.
Forrás:kaminopedia.hu